Sekolah Islam Terpadu (SIT) AZKIA merupakan sekolah yang mengimplementasikan konsep pendidikan Islam berlandaskan al-Quran dan As-Sunnah. Konsep operasional SIT AZKIA merupakan akumulasi dari proses pembudayaan, pewarisan dan pengembangan ajaran agama Islam, budaya dan peradaban Islam dari generasi ke generasi.

Dalam aplikasinya, SIT AZKIA sekolah yang menerapkan pendekatan penyelenggaraan dengan memadukan pendidikan umum dan pendidikan agama menjadi satu jalinan kurikulum. Dengan pendekatan ini, semua mata pelajaran dan semua kegiatan sekolah tidak lepas dari bingkai ajaran dan pesan nilai Islam.

Misi dan tujuan utama pendirian SIT AZKIA adalah mewujudkan sekolah yang secara efektif mengembangkan proses pendidikan yang dapat menumbuhkembangkan potensi fitrah anak didik menuju visi pembentukan generasi yang ‘taqwa’ dan berkarakter pemimpin. Dengan berpijak kepada falsafah yang merujuk kepada pesan-pesan pendidikan Islam sebagaimana tercantum dalam Al-Quran, Selanjutnya Sekolah Islam Terpadu menegaskan misi pendidikannya yaitu :

1. Menuntaskan sasaran pembelajaran yang dicanangkan pemerintah dalam konteks  kurikulum nasional,
2. mengajarkan kemampuan membaca Al-quran dengan standar Tahsin dan Tartil ( membaca sesuai aturan hukum tajwid),  dengan Metode Qiroati dan kemampuan menghafal Al-Quran ( Tahfidzul Qur’an) dengan standar minimal dua juz setelah menyelesaikan program Qiroati,
3. Memperkuat pembelajaran agama Islam, dengan memperkaya konten kurikulum yang mengarah kepada pemahaman dasar akan ajaran Islam dan pembinaan pemikiran, sikap  dan perilaku yang baik,
4. Membina karakter/ muwashofat  kepada   peserta didik secara bertahap menuju terbentuknya generasi pemimpin yang cerdas dan taqwa.